Добрый день.
40 полос вы самостоятельно не сделаете, это большая и непростая работа, которую делают в типографии специальные программы и специально обученные люди. В Индизайне есть модуль PrintBooklet для спуска полос, но он предназначен для маленьких брошюр, которые ложатся по 4 полосы на лист (2+2). Журналы раскладываются на другие листы (обычно бОльшие, размер зависит от печатной машины) и расчёт там получается гораздо более сложный. Не давайте типографии заставлять вас делать их работу.

Очень странно, что типография хочет TIFF - вы уверены, что речь идёт не об отдельных модулях, а о целых полосах? Дело в том, что любая верстка (векторное по большей части изображение) при переводе в растр ВСЕГДА теряет качество. Из PDF у вас растровые картинки выведутся как растр, а векторные - как вектор, и их четкость будет примерно в 10 раз выше. Если же перевести в TIFF, то всё будет напечатано как растр - фотографиям всё равно, а текст заметно пострадает. Уточните, пожалуйста, что конкретно имели в виду печатники, когда говорили про TIFF.

По фотографиям: для нормального вывода на печать все фотографии надо переводить в TIFF CMYK (причем желательно именно с такими настройками, которые нужны типографии, надо их уточнить) в реальный размер с разрешением 300 dpi. Это необходимые операции для того, чтобы фотографии напечатались достаточно четко и теми цветами, которые должны быть, а не какими попало. Если не сделать нужный размер, фото будут расплывчатые или пикселизированные, если оставить JPG, то к изначально среднему ("любительскому") качеству добавятся артефакты JPG-сжатия, а если не перевести в CMYK, программа просто скажет вам, что в верстке имеются ошибки. Если будете упорствовать, цветоделение будет, конечно, сделано, но в результате лица запросто могут оказаться синюшными или малиновыми, а небо - серо-зеленым вместо голубого. Сомневаюсь, что вас это устроит.

типографий много, надо смотреть по сайтам, сравнивать работы и по возможности приезжать и общаться.

Для ситуации, когда формат журнала А4, а печатный лист А3, можно использовать в ИнДизайне модуль PrintBooklet с макетом 2-up Perfect Bound. Задать в поле signatire, например, 8 (для 40 полос получится 5 тетрадок по 8 страниц - по два печатных листа). Либо, если журнал собирается на скрепку, использовать макет 2-up Saddle Stich (весь макет в одну тетрадку). В этом случае возможно "выпучивание" центральных полос, если бумага сравнительно толстая. Чтобы не затеваться подсчетом величины сдвига, просто проверьте, чтобы никакие значимые элементы макета не приближались к краям полосы ближе чем на 5 мм.

Разумеется, они должны суметь напечатать из PDF, это абсолютно нормальная практика. Если у них там есть хотя бы Acrobat Reader, то отпечатать готовые листы из PDF - совершенно не проблема.